关于商品房逾期办证违约金的诉讼时效，以下是详细解释：

　　一、诉讼时效的起算

　　根据《中华人民共和国民法典》的规定，诉讼时效期间从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。对于商品房逾期办证违约金的情况，诉讼时效通常从开发商逾期办证之日起算。

　　如果商品房买卖合同中明确约定了逾期办证违约金的支付日期，那么诉讼时效从约定日期的次日开始计算。这是因为，当合同约定的支付日期到来时，如果开发商未支付违约金，权利人的权利即受到损害。

　　二、诉讼时效的计算方式

　　根据《民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这意味着，权利人应在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内提起诉讼。对于商品房逾期办证违约金的情况，权利人应在开发商逾期办证之日起三年内提起诉讼。

　　如果合同中约定的违约金是按日计算的，例如每日按业主已付购房款的万分之一计算，那么每一天都会产生一个新的违约金债权。对于这种情况，业主应当在每个债权产生之日起三年内提起诉讼。超过三年起诉的，法院可能只支持业主起诉日向前倒推三年内的逾期办证违约金。

　　三、诉讼时效的终止

　　诉讼时效期间届满时，诉讼时效终止。这意味着，如果权利人在诉讼时效期间内没有提起诉讼，那么他将丧失通过法律途径追讨违约金的权利。

　　但是，如果权利人在诉讼时效期间内提起诉讼或者向义务人提出履行请求等，那么诉讼时效将中断并重新起算。此外，如果义务人同意履行义务，诉讼时效也会中断并重新起算。

　　四、法律依据和案例

　　法律依据：《中华人民共和国民法典》第一百八十八条规定了向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，以及诉讼时效期间的起算方式。

　　案例：例如，李某购买北京市某开发商的商品房，约定签订房屋买卖合同后三十日内办理房屋买卖过户手续。然而，开发商一直未办理房产证。几年后，李某将开发商诉至法院，要求开发商立即为其办理房产证并给付自违约之日起至房产证办理完毕的违约金。在这个案例中，如果李某在开发商逾期办证之日起三年内提起诉讼，那么他的诉讼请求将得到法院的支持。否则，如果超过了诉讼时效期间，他的诉讼请求可能会被法院驳回。

　　综上所述，对于商品房逾期办证违约金的诉讼时效问题，权利人应注意起算时间、计算方式以及终止条件，以免丧失通过法律途径追讨违约金的权利。